本キットは、次世代シーケンサー(illuminaおよびMGIプラットフォーム)用の高品質ライブラリーを構築するために開発されました。本キットは、NGSライブラリー調製のためのインプットDNAとして二本鎖DNA断片(ブラントおよび/またはスティッキー)を必要とし、酵素的方法および物理的方法(超音波処理、ネブライゼーションなど)の両方から生成されたDNA断片に対応しています。異なるタイプのインデックスを用いたライブラリーの多重化が可能です。
本キットは、様々な種類のサンプルを用いた次世代シーケンシング(NGS)ライブラリー調製用に最適化されています。DNAライブラリー調製のほとんどは、剪断したDNA断片をライブラリーアダプターにライゲーションする必要があり、DNAライブラリー調製はNGSデータの質と密接に関係している。BioDynamiのユニークなDNAライブラリー調製技術により、この迅速でシンプルなキットは、わずか10分の作業時間で高品質のNGSライブラリー調製を1.5時間で完了することができます。
ゲノム領域の中には、均一にカバーすることが非常に困難な領域があり、そのような領域では通常、カバー率が非常に低くなったり、ギャップが生じたりします。
代表的な困難領域は以下の通りです:
- GC含量が高い
- 二次構造を持つ:主に繰り返し配列による
- 最悪のケース:高いGC含量と繰り返し配列の両方を持つ。
例:ヒトTERT遺伝子は上記のように最も困難な領域の一つである。NGSのデータから、BioDynamiキットは非常に困難なヒトTERT遺伝子領域をカバーする最高のパフォーマンスを持っていることが示された。
イルミナプラットフォームキットには3種類のインデックスが用意されています:
Non-index : インデックスのないライブラリー。
インデックス : 各インデックスプライマーに6塩基のユニークなバーコード配列が含まれています。
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