Multiplexing Unique Dual Index Primersには、illuminaプラットフォーム上の次世代シーケンス(NGS)サンプルをマルチプレキシングするためのプライマーミックスが含まれています。NGSサンプルのマルチプレキシングにより、複数のNGSライブラリーを1つのフローセルレーンにプールすることで、シーケンスコストを削減することができます。
我々は4塩基差インデックスシステムを開発した。このシステムにより、8塩基のインデックス長において、少なくとも4塩基が異なるインデックスを作成することができる。当社独自のデュアルインデキシングプライマーは、インデックスのホッピング、インデックスのクロスコンタミネーション、リードのミスアサインメント、増幅エラー、デマルチプレックスエラーなどのシーケンスエラーを除去します。
特徴
4塩基差インデックスシステムによるサンプル同定特異性の向上
各インデックスは少なくとも4塩基が他のインデックスと異なる
他ベンダーの3塩基差に比べ、4塩基差は特異性を大幅に向上させます。
多重化能力の向上
96組のi5およびi7インデックスプライマーがあらかじめ混合されています。
以下のようなシーケンスエラーを最小限に抑えます:
インデックスのホッピング
インデックスのクロスコンタミネーション
リードのミスアサインメント
増幅エラー
デマルチプレックスエラー
ユニークデュアルインデックスによるインデックスホッピングの同定。BioDynami NGS DNA Library Prep KitとBioDynami Multiplexing Unique Dual Index Primersを使用して96個のライブラリーを作製した。ライブラリーは等濃度でプールされ、illumina HiSeq 4000でシーケンスされた。全ライブラリーからのリード数をデマルチプレックスし、解析した。
デマルチプレックス:正しいi5とi7のインデックスの組み合わせ
特定されたインデックスホッピング:バーコードは正しいが、i5とi7のインデックスの組み合わせは正しくない
その他:上記のカテゴリーに当てはまらない
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