NGS FFPE DNA Library Prep Kit (illumina and MGI Platforms)は、ホルマリン固定・パラフィン包埋(FFPE)サンプルから単離した10 ng~400 ngのインプットDNAを用いて、高品質のFFPE DNAライブラリーを構築するために開発されました。固定によるDNA損傷は、高品質なライブラリーの構築を困難にしています。当社のキットは、反応中の損傷DNAを修復するように最適化されている。NGS FFPE DNAライブラリーの多重化が可能です。
FFPEサンプルは生物医学研究のための素晴らしいリソースである。しかし、固定方法や保存状態により、サンプル中のDNAは著しく損傷します。 そのため、FFPEサンプルから高品質のDNAを抽出することはしばしば困難である。 通常、FFPE DNAの収量や品質が低いのは、組織材料が限られていることやDNAが劣化していることが原因である。
その結果、低量・低品質のFFPE DNAから高品質のNGSライブラリーを構築することは通常困難である。この問題に対処するため、私たちは、低インプットのFFPE DNAサンプルから高品質のライブラリーを作成するためのNGS FFPE DNAライブラリー調製キットを開発しました。
イルミナプラットフォームのNGS FFPE DNA Library Prep Kitには3種類のインデックスが用意されています:
Non-index : インデックスのないライブラリー。
Index : 各インデックスプライマーには、個々のライブラリーを識別するためのユニークなバーコードDNA(6塩基長)が含まれています。最大48サンプルまでマルチプレキシングが可能です。インデックス情報はこちらからダウンロードできます。
ユニークなデュアルインデックスFFPE DNAライブラリーのマルチプレキシングは、独自のデュアルインデックスシステムに基づき96サンプルまで可能です。
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