PCRフリーのNGS DNA Library Prep Kitは、次世代シーケンサー(illuminaプラットフォーム)用のDNAライブラリーを構築するために開発された。このキットは、DNA断片の両末端に3′-dT-tailedライブラリーアダプターを効率的に付加します。本キットは、二本鎖DNA断片(ブラントおよび/またはスティッキー)をNGSライブラリー構築のためのインプットDNAとして使用し、酵素的方法(BioDynami DNA断片化酵素など)および物理的方法(超音波処理、ネブライゼーションなど)の両方から生成されたDNA断片に対応しています。
PCR増幅は次世代シーケンサーのライブラリー調製の標準的なステップです。PCRは、完全にライゲーションされたDNA断片を増幅し、ライブラリにインデックス情報を付加するために使用されます。インデックス情報は、シーケンスコストを削減するためにライブラリーサンプルをプールするためのものです。
しかし、PCRでは、GC含量や二次構造が極端に異なるDNA領域において、DNAの増幅に偏りが生じる。このバイアスは、そのような領域でのシーケンスカバレッジを非常に低くする原因となります。このような領域でのDNAシーケンスは、依然として大きな課題である。
PCRフリーライブラリープレパレーションは、ライブラリーのバイアスを減らし、シーケンスギャップを最小限に抑えることができます。PCRフリーライブラリーサンプルからのシーケンスデータは、ギャップが少なく均一なゲノムカバレッジを持ち、GCリッチ領域での深度も良好です。当社のPCRフリーNGSキットは、高GC含量領域、低GC含量領域、反復配列領域など、従来困難であった領域において最適なカバレッジを提供します。
このキットには2種類のインデックスが用意されている:
ノンインデックス:ライブラリーにインデックスはありません。
インデックス:各ライブラリにはi5インデックスとi7インデックスが1つずつ含まれます。 最大96サンプルまでライブラリーの多重化が可能です。インデックスのリストはこちらからダウンロードできます。
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