CATCH-Seq技術に基づき、全ゲノムNGSライブラリーからMHC遺伝子座を捕捉するために開発されたキット(下記)。さらに、NGSライブラリー前処理とMHC遺伝子座のキャプチャーを組み合わせたキットもあります。ライブラリー前処理とMHC遺伝子座キャプチャーを統合することで、手順が簡素化されるだけでなく、キャプチャー効率も向上する。当社のキットを用いて選択した遺伝子座の包括的なシーケンスを行うことで、他のMHCターゲットシーケンス試薬ではカバーできないSNP、インデル、構造変異の検出が可能になります。
特徴
ライブラリー調製とキャプチャー、またはキャプチャー単独の統合
手順の簡素化
キャプチャー効率の向上
対象となるMHC領域は複数選択可能
以下の領域のキットが利用可能
3.8MBのMHC領域全体
2.1MBのクラスI領域
0.7 MB クラスII領域
1.1 MB クラス III リージョン
190 kb MHCコア領域(22個のMHC遺伝子)
エクソン、イントロン、5'制御領域、3'制御領域、およびそれ以降をカバーする。
SNP、インデル、構造変異の容易な検出
インタクトな配列情報を提供する唯一の試薬
低コスト
サンプルの多重化:最大96サンプルをプールすることができ、さらにコストを削減できる。
インデックス24反応キットの場合。最大24ライブラリーのサンプル多重化が可能。各インデックスプライマー(#1~#24)には、ライブラリーの識別に使用できるユニークな6塩基のインデックス配列があります。
ユニークなデュアルインデックス:96反応および384反応のキット用。最大96ライブラリーのサンプルマルチプレックスが可能。
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