Nexus Copy Number ソフトウェアは、アレイ、NGS パネル、WES/WGS、発現データなど、複数のデータタイプを研究コホート間で解析し、ゲノムワイドなビューを実現します。様々な高度な解析・可視化ツールにより、驚くほどシンプルな操作で新たな知見を明らかにすることができます。
表現型データとゲノムデータを統合し、重要な遺伝的相関を明らかにします。
サンプルのアノテーションや属性を無制限に関連付け、ダウンストリーム解析を行うことができます。予測力ツールを使用して、表現型属性とゲノムの変化の相関を見つけ、がんサンプルの生存分析を行い(Kaplan-Meirプロットを使用)、異常プロファイルと表現型に基づいてサンプルを層別化してドライバー変異を特定します。Nexus Copy Numberでは、K-meansまたは階層型クラスタリングによるグループ化が可能で、クラスタ数を調整することができます。GSEAを使用して、ゲノム全体に濃縮された遺伝子オントロジー(GO)用語を特定するか、選択した領域のみに有意に過剰発現しているGO用語を見つける。コンコーダンス機能を使用して、コピー数変化、LOH領域、小さな変異と共起するゲノム変化を特定し、これらの関係をサークルプロットで表現します。
バイオインフォマティクスの専門知識がなくても、複数のサンプルを並行して分析・可視化することができます。
Nexus Copy Numberは、グラフィカルで統計的なプログラミングの専門知識がなくても、堅牢な統計関数と豊富なインタラクティブグラフィックを提供します。数万個の高密度アレイを並行して可視化・解析できる、強力なデスクトップ(WindowsまたはMac OS)ソリューションです。
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