GlycoScape™ は、糖鎖生物学におけるリアルタイム糖ペプチド解析のプラットフォームです。
現在の装置とサンプルの状態を知らせるリアルタイム解析
分析時間
糖ペプチドの同定には時間がかかることが知られています。データ取得が完了するとすぐに結果が出力されるため、このステップは不要になります。
費用
計測時間、試薬、サンプルの調製にはコストがかかります。GlycoScape™ の Run & Done を使用すると、次のサンプルを注入する前に意味のあるデータが生成されていることが保証されるため、コストを節約できます。
装置の時間
お客様にとって一分一秒が重要であることを私たちは理解しています。GlycoScape™ を使用すれば、装置の時間を最も生産的な方法で活用できることが保証されます。
貴重なサンプル
貴重なサンプルを節約します! 糖ペプチドのサンプル調製には時間がかかり、コストもかかります。GlycoScape™ のスマートな機能により、貴重なサンプルが無駄にならないようにします。
リアルタイム検索結果とスマートなデータ取得機能を備えた 4D-グライコプロテオミクス
GlycoScape™ が提供するリアルタイムの糖ペプチド同定とスマートなデータ取得機能を統合することで、データ分析のボトルネックを克服します。
普遍的に利用可能
現在および将来のすべての timsTOF Pro、timsTOF HT、timsTOF fleX、timsTOF SCP、および timsTOF Ultra プラットフォームは、GlycoScape™ にアクセスできます。GlycoScape™ は、追加費用なしで Bruker ProteoScape™ とバンドルされています。
4D-グライコプロテオミクス
CCS 対応データのサイズが大きい場合でも、GlycoScape™ を使用すれば、リアルタイムの糖ペプチド同定が可能になります。GlycoScape™ は、ペプチド同定に GPU 搭載の ProLuCID アルゴリズムを使用し、糖鎖組成には Myriad アルゴリズムを組み合わせています。
GlycoScape™ データレビュー
GlycoScape™ が提供する統合ビューアを使用して、高レベルの実験情報から特定のフラグメントイオンスペクトルまで、データのあらゆる側面を自信を持って表示します。
スマート - 取得コントロール
GlycoScape™ は、サンプル取得の最後にユーザー定義の糖ペプチドの適格性/パラメータを許可し、適合性をチェックしながら、また貴重なサンプル、高価な消耗品、および計測時間を節約しながら、サンプルキューの進行をシームレスにガイドします。
Myriad ワークフロー – リアルタイム糖ペプチド同定
最初に Myriad ワークフローを説明したのは Armony らでした
(https://doi.org/10.3390/ijms24097869)。このワークフローは、一般的な N-結合型糖鎖フラグメントを使用して、糖ペプチドフラグメンテーションスペクトルをペプチドと糖鎖部分スペクトルに効果的に分解します。次に、各部分は特殊なリアルタイムアルゴリズムによって同定され、その後糖ペプチドが「再構成」されます。Myriad ワークフローの大きな利点は、糖鎖データベースを必要とせず、データベースにない糖鎖を同定し、偽陰性を最小限に抑えることができることです。
Myriad ワークフローは、glyco-PASEF データ取得の速度に対応し、他の糖プロテオミクスソフトウェアスイートと同様のパフォーマンスを実現します。文献参照データに沿って即座に結果を生成するため、分析時間の要件が大幅に削減されます。