ユーザーフレンドリーなアノテーションおよびバリデーションツールを使用してトップダウンデータ分析を合理化し、迅速かつ確実な結果を保証します。
トップダウン配列解析ソフトウェア
OmniScape™ でターゲットタンパク質を理解する
信頼性
革新的な OmniWave™ アルゴリズムは、複雑な MSn データから信頼性の高いピークリストを抽出する作業を簡素化します。
汎用性
OmniScape™ はあらゆる MS 装置からのデータを処理し、補完的なメソッドの使用を容易にします。
柔軟性
de novo ホモロジーまたは in silico 検索との互換性により、未知または定義済みの配列から解析を始められます。
確実性
ピーク割り当てのインタラクティブな検証用のクラス最高のツールにより、プレゼンテーションの準備に向けたスペクトルの包括的なアノテーションが可能になります。
柔軟性と使いやすさを最適化
OmniScape workflow
OmniWave™ によるスペクトル注釈により、新規または検証ワークフローの高品質な入力が保証されます。
OmniWave™ によるスペクトル注釈により、新規または検証ワークフローの高品質な入力が保証されます。
トップダウン MS データの整理と分析は困難な場合があります。それ故に、プロテオフォームレベルの分析ではなく、ボトムアップ分析が好まれることがよくあります。しかし、インタクトレベルでのタンパク質の特徴付けにより、生物学を理解するための独自の視点を得ることができます。
OmniScape™ は、典型的なボトルネックに対処することで、データ処理の課題を軽減し、トップダウン分析を主流にすることを目指しています。
・トップダウンスペクトルは、多価のイオン種が広範囲に存在し、ピーク密度が高いため、多くの場合複雑になります。OmniScape™ は、OmniWave™ アルゴリズムを使用してこの問題に対処し、ユーザーが高品質のピークリストを作成できるようにします。
・科学者は、未知物質の特定から組換えタンパク質の配列検証まで、幅広い分析上の問題に直面する可能性があります。OmniScape™ は、相同性検索とテンプレート配列に基づく配列マッピングを組み合わせた de novo 解析をサポートし、これらの複数の要件に対応します。
・個々のピークを手動でバリデーションするのは面倒で、非常に時間がかかります。OmniScape™は、一致の品質を迅速に検証するための広範なサポートにより、高質量精度装置のユーザーの分析を加速します。
多くの場合、単一の分析メソッドでは、複雑なプロテオフォームのランドスケープを含む完全なタンパク質の複雑さを捉えるには不十分です。OmniScape™ は柔軟性を重視して設計されており、ユーザーはほとんどの ESI または MALDI 装置からデータをインポートしたり、複数のフラグメンテーションモードを使用して実験を組み合わせたりすることができます。
ユーザーは、必要なタンパク質特性評価のレベルに応じて、de novo タンパク質同定または PTM およびその他のプロテオフォームによる配列検証の 2 つの操作モードにアクセスできます。
De novo 解析
ここでは、ソフトウェアは、相同性ベースの検索用にすでにフォーマットされている配列タグを計算するための合理化された手順 (OmniWave™) を提供します。ピーク検証とタグ生成が高速化されるため、手作業にかかる時間を節約できます。
配列検証
事前の知見または相同性検索結果からテンプレート配列が利用可能になると、OmniScape™ を使用してvariableな修飾を含む配列に対するデータを簡単に評価できます。同定結果を比較して最も可能性の高いプロテオフォーム候補を決定できるため、結果の比較や追跡が容易になります。