このコンストラクトは通常、ターゲットタンパク質の全体、あるいは少なくとも機能的なドメインと、多くの種類のレポーター蛍光タンパク質のいずれかを融合させたものである。キノコの仲間であるDiscosoma sp.由来のものは、一般に赤色蛍光タンパク質(RFP)と呼ばれる。RFP融合タンパク質の構築物を用いて細胞を画像化するのは簡単ですが、その全体像を把握するためには、目的のタンパク質(またはタンパク質ドメイン)の生化学的情報を追加して組み合わせることがよくあります。このような生化学的な実験では、通常、精製が可能な別の「タグ」ドメインを用いた2つ目の融合タンパク質を設計します。このような追加のin vitro分析は、「タグ」付き融合構築物の機能性を確認したり、細胞環境で形成される可能性のある多タンパク質複合体を引き出すために使用することができます。特異的で信頼性が高く、効率的な試薬がないため、RFPや関連する蛍光性融合タンパク質の使用は、細胞生物学研究および生化学的な直接分析の両方で制限されています。
RFP-Trapsは、アガロースビーズや磁気アガロースビーズに結合した超高親和性アルパカ抗体断片を利用しています。この「Nanobody-Traps」は、従来のマウスモノクローナル抗体と比較して最大10倍の純度(および収率)で、免疫沈降、免疫精製、および免疫プルダウン実験に最適です。Nanobody-Trapsは、哺乳類細胞、組織・臓器、細菌、酵母、さらには植物など、さまざまな原料に適合します。これらの試薬により、RFP融合体は、免疫沈降、Co-IP、質量分析、酵素活性測定、ChIP解析の完璧な候補となります。
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