蛍光融合タンパク質は、タンパク質の局在や細胞動態を研究するための一般的なツールである。これらの融合タンパク質は、通常、ターゲットタンパク質の全体、あるいは少なくとも機能的なドメインを、多くの種類のレポーター蛍光タンパク質のうちの1つに融合させるものである。二量体の緑色蛍光タンパク質TurboGFPは、カイアシ類のPontellina plumataの緑色蛍光タンパク質CopGFPに由来する(Shagin et al.、2004)。482nmに励起極大、502nmに発光極大を持つ明るい緑色の蛍光を有しています。TurboGFPは成熟の早いタンパク質で、細胞内での蛍光シグナルは他の緑色蛍光タンパク質よりも早く見えるようになります。TurboGFPはクラゲのGFPバリアントと約20%の配列同一性を持つに過ぎません。そのため、ほとんどの抗GFP抗体はTurboGFPに結合しません(GFP-Trapで使用しているGFP-Nanobodyを含む)。TurboGFP融合タンパク質の構築物を用いて細胞を画像化するのは簡単ですが、その全体像を把握するためには、このような画像データを、目的のタンパク質(またはタンパク質ドメイン)の追加の生化学的情報と組み合わせることがよくあります。
このような生化学的な実験では、通常、精製を可能にする別の「タグ」ドメインを使用して、2番目の融合タンパク質を設計します。このような追加のin vitro分析は、「タグ」付き融合構築物の機能性を確認したり、細胞環境で形成される可能性のある多タンパク質複合体を引き出すために使用することができます。特異的で信頼性が高く、効率的な試薬がないため、GFPや関連する蛍光性融合タンパク質の使用は、細胞生物学研究および生化学的分析の両方において制限されている。
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