リボタイピングは、制限酵素を利用してリボソームRNA遺伝子(5S、16S、23S、およびGlu-tRNAを含むスペーサー領域)の領域を標的として切断し、菌株レベルで生物に固有のDNAフィンガープリントを生成するフラグメントベースの技術である。
Ribotyping システムは、RiboPrint® パターンが一定の類似度の範囲内にあるサンプルをグループ化します。これらのパターンは、互いに先行または後続して生成することができ、環境モニタリング(EM)プログラムにおける追跡調査や傾向分析の一環として、分離株間の類似度を判定するために使用することができます。当社のチームは、リボプリンティングのためにサンプルを提出した顧客ごとにカスタムライブラリを構築し、管理しています。顧客が新しいサンプルを提出するたびに、そのサンプルはカスタムライブラリ内の過去のすべてのサンプルと比較され、リボグループに割り当てられました。
RiboPrinter® で解析されるリボソーム RNA オペロン内にはほとんど多様性がない種があるため、自動リボタイピングは配列ベースの株タイピングよりも効果が低い場合があります。このような場合、配列に基づく細菌株特性解析法(SLSTおよびMLST)は、自動リボプリンティングよりもはるかに高いレベルの識別と再現性を提供できるため、強く考慮する必要があります。
細菌株のリボタイピングとは何ですか?
リボタイピングは、細菌の特性解析のためのRiboPrinter®システムを使用した、生物のDNAフィンガープリントの自動フラグメントベース解析です。
リボプリンティングパターンとは何ですか?
リボプリンティングは、制限酵素を利用してリボソームRNA遺伝子(5S、16S、23S、
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