2'-デオキシ-2'-フルオロ-ヌクレオシドは、フッ素の高い電気陰性度のため、おそらくRNA型の糖構造をとる。この糖構造のため、RNA二重鎖(A-form)はDNA二重鎖(B-form)よりも一般に熱力学的に安定であることが分かっている。予想通り、オリゴデオキシヌクレオチドに2'-F-RNA残基を付加すると、RNAとの二重鎖の熱安定性が徐々に増加する。この安定化は、1残基あたり約2°の相加的なものである。これは、2'-OMe-RNAが約1.5°、RNAが1.1°であることと比較すると有利である。一方、塩基対の特異性はそのまま維持されている。
2'-F-RNAのホスホジエステル結合は、対応するホスホロチオエート結合は高い耐性を持つが、ヌクレアーゼには耐性がない。しかし、2'-F-RNA/RNA二重鎖はRNase Hの基質にはならない。しかし、RNA標的への結合力が強く、RNase Hの基質であり、ヌクレアーゼ耐性が高いキメラ2'-F-RNA/DNAホストロチオエート・オリゴヌクレオチドを調製することは簡単である。
仕様
化学成分
分子量/重量 - 307,17
保存と安定性
再懸濁条件
- チューブを短時間スピンさせ、ペレットをチューブの底に集める - 推奨バッファーを適量加える(テクニカルデータシートを参照) - チューブを数分間放置する - チューブを15秒間ボルテックスする
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