AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2は、Catalogue of Somatic Mutations in Cancer(COSMIC)1データベースで同定された、がんとの関連が知られている50遺伝子のホットスポット領域にわたる体細胞変異を調査するためのターゲットリシーケンスアッセイです。主な特徴は以下の通り:
関連遺伝子コンテンツ
50の癌遺伝子および癌抑制遺伝子から約2800のCOSMIC変異をターゲットとする
高速で合理的なワークフロー
わずか1 ngの高品質サンプルまたは10 ngのホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルから1日でシーケンス可能なライブラリーを調製
正確なデータ
ローカルまたはクラウドベースの解析を使用して、バリアント対立遺伝子頻度5%までの体細胞変異を検出
Cancer HotSpot Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応(PCR)ベースのライブラリー調製、Illuminaシーケンスバイシンセシス(SBS)次世代シーケンス(NGS)テクノロジー、および自動解析を含む統合ワークフローの一部です。
このパネルにより、肺がん、大腸がん、乳がん、卵巣がん、メラノーマ、前立腺がんを含む複数のがん種で高感度のバリアント検出が可能になります。すぐに使えるパネルなので、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化などの時間と労力を節約できます。
仕様
アッセイ所要時間 - 5時間(ライブラリー前処理のみ;ライブラリー定量、正規化、プーリングの時間は含まない)
がん種 - 汎がん、固形がん
内容物の仕様 - がんとの関連が知られている50遺伝子のホットスポット領域
説明 - 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域の体細胞解析研究。
実習時間 - 1.5時間未満
入力量 - 1-100 ng (プールあたり10 ng推奨)
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