AmpliSeq for Illumina Focus Panelは、固形がんとの関連性が知られている52遺伝子のバイオマーカー解析のためのターゲットリシーケンスアッセイです。Focus Panelを使用することで、研究者はDNAとRNAの両方を同時に解析することができます。主な特徴は以下の通りです:
関連遺伝子コンテンツ
固形癌に関連する52遺伝子のバイオマーカーをターゲットとする
高速で合理的なワークフロー
わずか1 ngの高品質サンプルまたは10 ngのホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)インプットサンプルから、シーケンス準備完了のライブラリーを1日で調製
正確なデータ
ローカルまたはクラウドベースの解析を使用して、頻度5%までの体細胞変異を検出
Focus Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応(PCR)ベースのライブラリー調製、Illuminaシーケンスバイシンセシス(SBS)次世代シーケンス(NGS)テクノロジー、および自動解析を含む統合ワークフローの一部です。
このすぐに使えるパネルは、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化などの時間と労力を節約します。
仕様
アッセイ時間 - 5~6時間(ライブラリー前処理のみ;ライブラリー定量、正規化、プーリングの時間は含まない)
がんの種類 - 固形がん
説明 - 固形がん関連52遺伝子の体細胞解析研究。
所要時間 - 1.5時間未満
入力量 - 1-100 ng (プールあたり10 ng推奨)
アンプリコン数 - 合計553。2プール。(DNAプール:269アンプリコン、RNAプール:284アンプリコン)
特殊なサンプルタイプ - FFPE組織
バリアントクラス - 一塩基多型(SNPs)、遺伝子融合、体細胞バリアント、挿入-欠失(indel)、コピー数バリアント(CNVs)
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