がんゲノミクスの専門家との共同研究により開発された、あらかじめデザインされた、すぐに使えるオリゴは、研究者が、これまでがん素因と関連していたさまざまな遺伝子や一塩基多型(SNP)の配列を決定することを可能にする。
がん素因に関連する94の遺伝子と284のSNPをターゲット
TruSight Cancerには、一般的ながん(乳がん、大腸がん等)と希少がんの両方に関連する遺伝子が含まれている。さらに、ゲノムワイド関連研究(GWAS)によりがんとの相関が発見された284SNPも含まれている。コンテンツの選択は、科学文献やその他の質の高いリソースの専門家によるキュレーションに基づいている。
TruSight Cancerシーケンスパネルは、特定された関心領域をターゲットとするカスタムオリゴを提供する。4回の濃縮反応に十分な製品が供給される。TruSight CancerはTruSight Rapid Captureと互換性があります。
TruSight Cancerサンプルデータセット
TruSight Cancerシーケンスパネルを使用して、ヒトの参照サンプル6件を調製しました。これらのライブラリーは、MiniSeqシステムで高出力キットを使用し、2 x 100 bpのリード長構成、デュアルインデキシングでシーケンスされました。総収量は5.2Gbで、95.8%の塩基がQ30以上であった。
仕様
アッセイ時間 - 1.5日
がんの種類 - 汎がん
内容物の仕様 - 一般的ながんとまれながんに関連する94の遺伝子と284のSNPを濃縮するプローブの固定セット。
説明 - 一般的ながんおよびまれながんの生殖細胞系列変異検出研究。
実習時間 - 5 時間
入力量 - 50 ng DNA
装置 - MiSeqシステム、NextSeq 550システム、リサーチモードのMiSeqDx、MiniSeqシステム、NextSeq 500システム
方法 - ターゲットDNAシーケンス、ターゲット濃縮
マルチプレックス - 最大96プレックス
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