HLAシーケンス用ソフトウェアモジュール SEQHLA

実験用分析

SEQHLAは、すべてのサンガー配列プラットフォームからのHLA配列に基づくタイピングデータを解析するための、強力でユーザーフレンドリーなアプリケーションです。IMGT HLAデータベースの全バージョンをダウンロードおよびインポートすることが可能です。ピーク面積統計データに基づく独自の学習型ベースコーラーを使用し、独自の自動編集機能を備えています。 必要に応じて定位置を無視して解析することができます。結果は、最大、1フィールド、2フィールドの解像度、およびNMPDコードで表示することができます。すべての結果データは、検査室内のLIMシステムに転送したり、個人用の患者レポートとして発行したりすることができます。 すべての一般的なサンガーシーケンスプラットフォームおよびキットのデータに対応 IMGT HLAデータベースをもとに、個々のターゲット領域を簡単に設定できる。 シーケンサーに依存するスレッショルドを持つベースコーラーを設定可能。 シーケンス結果ファイルの自動トリミングおよびユーザー定義トリミング 検出された対立遺伝子の組み合わせを含む、1つの画面に表示される1人の患者のすべての結果。 スプライスサイト変異の自動警告 定位置を無視して解析することが可能 新しい対立遺伝子の検出 異なる解像度（1フィールド、2フィールド、最大解像度）およびNMDPコードで結果を表示します。 ピーク面積統計：過去に分析したすべてのサンプルとの自動比較により、対立遺伝子の脱落があってもヘテロ接合位置を高感度に検出することができます。 個々の患者／注文の詳細なHLAレポート