当社のDepleteX High Expressing RNA Depletionキットは、シークエンシングの前にインビトロで高発現転写産物を除去し、シークエンシングリードの約70%*をユニークな生物学的関連転写産物に再分配します。
線維芽細胞および全血における検出感度の向上
高発現の転写産物を再シーケンスしても、生物学的に関連する情報はほとんど追加されません。残念なことに、これらの転写産物は低発現転写産物と競合し、シーケンスカバレッジが低下します。このカバレッジ不足は、高発現転写産物による著しいノイズと相まって、疾患のドライバーとなり得る低発現遺伝子、希少バリアント、ユニークな融合イベントの検出を制限します。
DepleteXは、Cas9と、線維芽細胞および全血由来のポリA選択RNA-Seqライブラリーから高発現転写産物の70%を除去するように設計されたガイドRNAセットを活用する。このガイドセットは、希少な低発現転写産物やユニークな融合イベントのシーケンスカバレッジを向上させるために、全シーケンスリードの再アサインメントを最大化するように設計されています。
ハイライト
全血および線維芽細胞における4,000以上の高発現転写産物を除去
生物学的に関連性の高い低発現転写産物に約70%*のリードを割り当て
より少ないシーケンスでバリアントとアイソフォームの検出を最大化
低発現転写産物の検出を増加
シンプルで柔軟なプロトコールでワークフローに簡単に統合
プロトコールについて
キットにはガイドRNAとポストライブラリー枯渇用試薬が含まれています。
仕様
キットあたりのサンプル数 - 24
評価対象組織 - 線維芽細胞、全血
高発現転写産物 - 約4,450件
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