DepleteX RNA枯渇パネルは、シークエンシングに先立ち、インスリン高発現転写産物をインビトロで除去し、シークエンシングクラスターをユニークな生物学的関連転写産物に再分配し、UMIと遺伝子感度を最大化する。
リボデプレッションを超えて、RNAサンプルは通常、少数の高発現転写産物を持ち、よく特徴付けられ、これらの転写産物を再シーケンスしても、生物学的に関連する情報はほとんど追加されません。残念なことに、これらの高発現転写産物は、低発現転写産物とシーケンシングカバレッジで競合します。このようなシーケンスカバレッジの不足は、高発現転写産物による著しいノイズと相まって、疾患ドライバーとなり得る低発現遺伝子、希少バリアント、ユニークな融合イベントの検出を制限する。
ハイライト
膵臓サンプル中の過剰発現転写産物を除去するためにデザインされたインスリンパネル
カバレッジを向上させるためにシーケンスリードを低発現転写産物に再割り当て
より少ないシーケンスでバリアントとアイソフォームの検出を最大化
について
キットは組織特異的ガイドRNAとポストライブラリー枯渇用試薬を含む
仕様
キットあたりのサンプル数 - 24
評価対象組織 - 膵臓
2つのインスリン遺伝子を欠失させるように設計
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