ポリ(A)選択を含む mRNA-Seq
幅広いトータルRNAインプット量(1 ng~1 μg)
オールインワンの簡単なワークフロー
5.5時間でポリ(A)選択からレディートゥシーケンスライブラリーまで完了
ユニーク分子識別子(UMI)を含む
12 nt ユニークデュアルインデックス (UDI) を含む
CORALL mRNA-Seq Library Prep Kitは、イルミナ® NGSプラットフォームを用いた全トランスクリプトームpoly(A) RNA解析のための鎖状、UMIラベル付き、およびユニークデュアルインデックスライブラリを迅速かつコスト効率よく作成することが可能です。
優れたエンドツーエンドカバレッジ
CORALLの包括的なカバレッジは、転写物の開始および終了部位の表示を改善します。ERCCスパイクインコントロールを使用して、リードのカバレッジを解析しました。CORALLのリードは、真の開始部位をカバーできない競合ライブラリに比べ、正確なERCC TSSにマッピングされています(図3A)。さらに、CORALLはTESをより正確にカバーすることができます(図3B)。
データ解析
BlueBee® Genomics Platformでは、データ解析パイプラインが利用できるようになりました。このパイプラインを利用することで、読み取りの品質管理、マッピング、Unique Molecular Identifier (UMI) の重複排除、および転写産物の定量を行うことができます。アクティベーションコードを使用するには、BlueBee(https://lexogen.bluebee.com/portal)にアカウント登録し、データ(fastq.gz ファイル)をアップロードしてください。
注!BlueBeeデータ解析は、様々な生物種に対応しています。FAQ 7をご参照ください。新しい生物種のリファレンスゲノムは、リクエストに応じて追加することができます。ただし、有料となります。詳しくは、CORALLデータ解析のページをご覧ください。
---