コスト効率に優れたゲノムワイドな遺伝子発現解析
1つの転写産物に対して1つのフラグメントしか生成しないため、シーケンスの深さを節約することができます。
高速かつシンプルなオールインワンプロトコル:4.5時間以下
低インプット(1 ng total RNA)およびFFPEサンプルに適しています。
バイオインフォマティシャンでなくても使える無料のデータ解析パイプライン
PCR重複検出のためのUMIを用意
NEW!最大384個のユニークデュアルインデックス(UDI)付きバンドル
QuantSeq FWD Kitは、ポリアデニル化RNAの3'末端に近い配列のイルミナ互換ライブラリーを作成するために設計されたライブラリー調製プロトコルです。
QuantSeq FWDは、2本目の鎖合成プライマーにIllumina Read 1リンカー配列を含むため、ポリ(A)テールに向かってNGSリードが生成され、mRNAの配列を直接反映します(ワークフローを参照)。このバージョンは、遺伝子発現解析の推奨規格です。Lexogenはさらに、オプションでデュアルインデックス(i5およびi7インデックス)を備えたハイスループット版も提供しており、1レーンで最大9216サンプルをマルチプレックスすることが可能です。
転写終了位置のマッピング
より長いリードを使用することで、QuantSeq FWDはpoly(A) RNAの3'末端を正確に特定できるため(図3参照)、3'UTRに関する正確な情報を取得することができます。
低入力・低品質サンプルの分析
トータルRNAの推奨投入量は1ngと少量です。QuantSeqは、FFPEサンプルを含む低品質RNAから再現性よくライブラリーを生成するのに適しています。同一サンプルの異なるRNA品質(FFPEと新鮮凍結クライオブロック)の比較はFig.1とFig.2をご覧ください。
---