転写体濃度の精密な推定
発現差の正確な検出
変動する条件下での卓越した再現性
高速なランタイムと小さなメモリフットプリント
Mix² RNA-Seqデータ解析ソフトウェア
RNA-SeqデータからRNA濃度を正確に推定するためのソフトウェアツールです。
モデル
RNA-Seqにおけるフラグメントバイアスは、遺伝子アイソフォームの正確な定量化に対して深刻な課題をもたらします。Mix²は、カバレッジバイアスについて仮定せず、各遺伝子アイソフォームについて混合モデルをデータに適合させます(図1)。したがって、Mix²は、例えば図1(aおよびb)に示すように5'バイアスを正確に表現できますが、一方Cufflinksは均一分布に制限されます(図1c)。
RNA-SeqデータからRNA濃度を正確に推定するためのソフトウェアツールです。
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