マイクロバイオーム解析では、人体、土壌、水、その他の生態系など、さまざまな環境に生息する微生物群集の組成、多様性、機能的可能性を研究する。
特にヒトマイクロバイオームとは、人体上や人体内部に生息し、健康や病気の様々な側面に影響を与える微生物(細菌、ウイルス、真菌など)の集合体を指す。
マイクロバイオーム解析は、これらの微生物と宿主との間の複雑な相互作用を理解し、これらの相互作用が健康、病気、生態系機能にどのような影響を与えるかを理解するために行われる。
あなたの腸を分析する
MagSi-DNA Stoolキットは、新鮮、凍結または安定化したヒト便サンプルからマイクロバイオームDNA(細菌/微生物と宿主DNAの混合物)を手動および自動で分離することを目的としています。
96サンプルの調製にかかる処理時間は、熱溶解インキュベーションを含めて約60分です。得られたDNAは、PCRやNGSなどのダウンストリームアプリケーションに直接使用することができます。
手順
MagSi-DNA Stoolは、ヒトの便サンプルから全DNAを分離するために最適化されています。MagSi-ST10磁性ビーズは取り扱いが容易で、最適な再懸濁と沈降を最小限に抑えるための保存用バッファーで提供されます。サンプルによってはRNAも共精製できます。
溶解しにくい細菌(グラム陽性菌など)を効率的に溶解するには、GP Lysis Tubesを用いた機械的破砕を推奨します。目的の微生物がボルテックスよりも強力なホモジナイズを必要とする場合、またはビーズビーターを使用したい場合は、Geno/Grinder®(SPEX Sample Prep)など、高出力のビーズビーターを使用することができる。
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