NEXome XP Panel v1.0は、拡張された全エクソームキャプチャーパネルです。NEXome Core Panelをベースに、非コードゲノム領域の臨床関連バリアントのカバレッジを拡大し、タンパク質コード領域のGENCODEアノテーションを含み、免疫グロブリン(IG)およびT細胞受容体(TR)コード遺伝子を包括的にカバレッジし、対象領域を全ゲノムのSNP骨格、固形癌に共通する遺伝子融合に関連するイントロニック領域、およびヒトゲノムの45.9 Mbの領域にまたがる古典的なマイクロサテライト遺伝子座に拡張しています。
製品詳細
非コード領域のクリンバーバリアント
NEXome XP Panel v1.0は、非コードゲノム領域における臨床関連バリアントのカバレッジを拡大します。
コーディング領域カバレッジの拡大
NEXome XP Panel v1.0は、タンパク質コード領域のGENCODEアノテーションをさらに追加し、IGおよびTRコード遺伝子を包括的にカバーしています。
全ゲノムのSNPスケルトン
1000 Genomesデータベースに基づき、主に中国人の集団においてMAF値が高く、ヘテロ接合性が高い9,000以上の遺伝子座を選択し、ヒトゲノム全体を約300Kb間隔でカバーしています。全ゲノムに基づくゲノム構成について、より豊富で均等な情報を提供し、CNVやヘテロ接合性の消失の検出に利用できる。
固形がんにおける一般的な遺伝子融合
古典的マイクロサテライト遺伝子座
NEXome Core Panel 自体が多数のマイクロサテライト遺伝子座をカバーしており、最適に設計された 15 の MSI 古典的遺伝子座を追加することで、異なる遺伝子座間の比較が容易になります。
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