NEXome Plus Panel v1.0は、強化された全エクソームキャプチャーパネルです。ヒトゲノムの43.3 Mb領域に及ぶNEXome Core Panelをベースに、全ゲノムのSNP骨格領域、固形癌に多い遺伝子融合に関連するイントロン領域、古典的なマイクロサテライト遺伝子座まで対象領域を拡張した。
全ゲノムSNP骨格
1000 Genomesデータベースに基づいて、主に中国人の集団でMAF値が高く、ヘテロ接合性が高い9,000以上の遺伝子座を選択し、ヒトゲノム全体を約300 Kb間隔でカバーしている。全ゲノムに基づくゲノム構成について、より豊富で均等な情報を提供し、CNVやヘテロ接合性の消失の検出に利用できる。
古典的なマイクロサテライト遺伝子座
NEXomeコアパネル自体が多数のマイクロサテライト遺伝子座をカバーしており、最適に設計された15個のMSI古典的遺伝子座が追加されたことにより、異なるマイクロサテライト不安定性分析法間の比較や、分析プロセスの最適化および較正が容易になりました。
このキットでRNAサンプルを直接ライブラリー調製に使用できますか?
いいえ。本キットは、初期サンプルとしてgDNAまたはcDNAにのみ対応しています。RNAサンプルの場合、ライブラリー調製の前にcDNAを生成するための逆転写が必要です。
推奨入力範囲はどのくらいですか?この範囲を超えるインプットはどのように扱えばよいですか?
本キットは50~2,000 ngのgDNAまたはcDNAに対応しています。入力量が2,000 ngを超える場合は、増幅効率を維持するためにサンプルを複数の反応に分割してください。
このキットのインサートサイズを教えてください。シーケンスリード長の選択方法を教えてください。
本キットを用いたPCR産物のメインピークは〜270 bpです。
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