NEX-t Panel v1.0は、ウイルス、細菌、真菌、寄生虫を含む数百種類の病原体のゲノムから選択された一連の特徴的な配列を対象としています。16S/ITS、ハウスキーピング遺伝子、薬剤耐性関連遺伝子など、豊富な内容をカバーしている。
性能
革新的でユニークなデザイン
NEX-t Panel v1.0は、主に以下の3つのコンポーネントで構成されています:
(1) 表1に示すように、ウイルス、細菌、真菌、寄生虫を含む数百の生物種の特徴的な配列に対して設計されたプローブ。
種または属内の複数の参照配列を比較し、プローブの許容範囲内で、ある程度の多様性を含む領域を選択。
Multi-Locus Sequence Typing(MLST)に関与する配列の組み込み。
関連文献の統合
(2) 16S/ITS用にデザインされたユニバーサルプローブの小さなセット。
複数のデータベース(SILVA,Greengenes,RDP,Unite)から参照。
(3)薬剤耐性、病原性、および関連遺伝子用に設計されたプローブ。
本キットでRNAサンプルを直接ライブラリー調製に使用できますか?
本キットは、初期サンプルとしてgDNAまたはcDNAにのみ対応しています。RNAサンプルの場合、ライブラリー調製の前にcDNAを生成するための逆転写が必要です。
推奨入力範囲はどのくらいですか?この範囲を超えるインプットはどのように扱えばよいですか?
本キットは50~2,000 ngのgDNAまたはcDNAに対応しています。入力量が2,000 ngを超える場合は、増幅効率を維持するためにサンプルを複数の反応に分割してください。
このキットのインサートサイズを教えてください。シーケンスリード長の選択方法を教えてください。
本キットを用いたPCR産物のメインピークは~270 bpです。高品質なカバレッジを得るためにはPE150シーケンスが推奨されます。
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