NanOnco Plus Panel v3.0は、固形がん研究で注目されている620の遺伝子(HLA遺伝子を含む)の全コード領域、一般的な融合に関連する一連のイントロン領域、古典的なマイクロサテライト配列、および化学療法関連多型遺伝子座をターゲットとしている。このパネルは、ゲノムの約2.4 Mbの標的領域をカバーする、合計637の遺伝子を含む。塩基置換、挿入/欠失、遺伝子再配列、遺伝子増幅、マイクロサテライト不安定性などを含む複数のバリアントの濃縮をサポートする。
このキットでRNAサンプルを直接ライブラリー調製に使用できますか?
本キットは gDNA または cDNA を最初のサンプルとしてのみ使用できます。RNAサンプルの場合、ライブラリー調製の前に逆転写してcDNAを作製する必要があります。
推奨入力範囲はどのくらいですか?この範囲を超えるインプットはどのように扱えばよいですか?
本キットは50~2,000 ngのgDNAまたはcDNAに対応しています。入力量が2,000 ngを超える場合は、増幅効率を維持するためにサンプルを複数の反応に分割してください。
このキットのインサートサイズを教えてください。シーケンスリード長の選択方法を教えてください。
本キットを用いたPCR産物のメインピークは~270 bpです。高品質なカバレッジを得るためにはPE150シーケンスが推奨されます。
IGTR免疫レパートリー解析に推奨されるシーケンスデータ量はどのくらいですか?
200 ngのインプットで0.01%の存在度でクローンを検出するには、最低0.3 Gbのデータ量を推奨します。低頻度クローンの感度を高めるには、データ量を増やしてください。
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