溶液試薬キット OncoFu Elite v1.0

研究用RNA分析

OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0は、固形癌研究において最も一般的、または臨床的に重要な融合に関連する105遺伝子をターゲットとしています。プローブは、RefSeq 109に正式に含まれる、融合イオンの発生に関与するすべての転写産物のコード領域といくつかのUTR領域をカバーしています。このパネルはRNAレベルでの融合、変異、遺伝子発現情報の濃縮をサポートする。 このキットでRNAサンプルを直接ライブラリー調製に使用できますか？ いいえ。本キットは初期サンプルとしてgDNAまたはcDNAにのみ対応しています。RNAサンプルの場合、ライブラリー調製の前にcDNAを生成するための逆転写が必要です。 推奨入力範囲はどのくらいですか？この範囲を超えるインプットはどのように扱えばよいですか？ 本キットは50～2,000 ngのgDNAまたはcDNAに対応しています。入力量が2,000 ngを超える場合は、増幅効率を維持するためにサンプルを複数の反応に分割してください。 このキットのインサートサイズを教えてください。シーケンスリード長の選択方法を教えてください。 本キットを用いたPCR産物のメインピークは～270 bpです。高品質なカバレッジを得るためにはPE150シーケンスが推奨されます。 IGTR免疫レパートリー解析に推奨されるシーケンスデータ量はどのくらいですか？ 200 ngのインプットで0.01%の存在度でクローンを検出するには、最低0.3 Gbのデータ量を推奨します。低頻度クローンの感度を高めるには、データ量を増やしてください。 このキットは最小残存病変（MRD）モニタリングに適していますか？ このキットには、IG Primer MixとTR Primer Mixが含まれており、遺伝子特異的プライマーは別々のチューブに入っているため、1回の増幅反応で自由に組み合わせることができます。