NanOnCT Panel v1.0は、固形がんおよびリキッドバイオプシーの解析用にデザインされたコンパクトなパネルです。本パネルは、選択された領域をカバーする合計69の遺伝子を含んでいます。最適化されたプローブ設計により、このパネルはFFPEおよび無細胞DNAの両方に対して、標的領域に対して非常に均一なカバレッジを提供します。
このキットでRNAサンプルを直接ライブラリー調製に使用できますか?
本キットは、初期サンプルとしてgDNAまたはcDNAにのみ対応しています。RNAサンプルの場合、ライブラリー調製の前にcDNAを生成するための逆転写が必要です。
推奨入力範囲はどのくらいですか?この範囲を超えるインプットはどのように扱えばよいですか?
本キットは50~2,000 ngのgDNAまたはcDNAに対応しています。入力量が2,000 ngを超える場合は、増幅効率を維持するためにサンプルを複数の反応に分割してください。
このキットのインサートサイズを教えてください。シーケンスリード長の選択方法を教えてください。
本キットを用いたPCR産物のメインピークは~270 bpです。高品質なカバレッジを得るためにはPE150シーケンスが推奨されます。
IGTR免疫レパートリー解析に推奨されるシーケンスデータ量はどのくらいですか?
200 ngのインプットで0.01%の存在度でクローンを検出するには、最低0.3 Gbのデータ量を推奨します。低頻度クローンの感度を高めるには、データ量を増やしてください。
このキットは最小残存病変(MRD)モニタリングに適していますか?
本キットには、遺伝子特異的なプライマーが別々のチューブに入ったIG Primer MixとTR Primer Mixが含まれており、1回の増幅反応で自由に組み合わせることができます。このキットは感度が高く、MRDモニタリング技術開発や臨床応用の要件を満たしており、低頻度のバリアント検出シナリオに最適です。
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