IGTR Panel v1.0は、ヒトゲノムの免疫グロブリン(IG)およびT細胞受容体(TR)をコードする全遺伝子セグメントをカバーしており、DNAレベルではV(D)J組換えによって再配列される前後のセグメントの濃縮に、RNAレベルでは成熟転写産物の濃縮に使用できます。
このキットでRNAサンプルを直接ライブラリー調製に使用できますか?
いいえ。本キットは、初期サンプルとしてgDNAまたはcDNAにのみ対応しています。RNAサンプルの場合、ライブラリー調製の前にcDNAを生成するための逆転写が必要です。
推奨入力範囲はどのくらいですか?この範囲を超えるインプットはどのように扱えばよいですか?
本キットは50~2,000 ngのgDNAまたはcDNAに対応しています。入力量が2,000 ngを超える場合は、増幅効率を維持するためにサンプルを複数の反応に分割してください。
このキットのインサートサイズを教えてください。シーケンスリード長の選択方法を教えてください。
本キットを用いたPCR産物のメインピークは~270 bpです。高品質なカバレッジを得るためにはPE150シーケンスが推奨されます。
IGTR免疫レパートリー解析に推奨されるシーケンスデータ量はどのくらいですか?
200 ngのインプットで0.01%の存在度でクローンを検出するには、最低0.3 Gbのデータ量を推奨します。低頻度クローンの感度を高めるには、データ量を増やしてください。
このキットは最小残存病変(MRD)モニタリングに適していますか?
本キットには、遺伝子特異的なプライマーが別々のチューブに入ったIG Primer MixとTR Primer Mixが含まれており、1回の増幅反応で自由に組み合わせることができます。このキットは感度が高く、MRDモニタリング技術開発や臨床応用の要件を満たしており、低頻度のバリアント検出シナリオに最適です。
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