ERCC RNA Spike-in Control Mixesは、米国標準技術局(NIST)によって開発されたもので、濃度が決定されたRNA配列から構成されています。リードカウントとRNA濃度に関する標準曲線を導き出すことができ、遺伝子発現実験の性能評価に広く使用されている。
Ext-RNA Control Panel v1.0は、長さ273-2,022 bp、濃度0.014305 attomol/μLから937.5 attomol/μLの範囲にある92のERCC転写産物のうち24を対象とした。24のERCC RNAは、RNA発現定量の外部コントロールとして機能する。
このキットでRNAサンプルを直接ライブラリー調製に使用できますか?
本キットは、初期サンプルとしてgDNAまたはcDNAにのみ対応しています。RNAサンプルの場合、ライブラリー調製の前にcDNAを生成するための逆転写が必要です。
推奨入力範囲はどのくらいですか?この範囲を超えるインプットはどのように扱えばよいですか?
本キットは50~2,000 ngのgDNAまたはcDNAに対応しています。入力量が2,000 ngを超える場合は、増幅効率を維持するためにサンプルを複数の反応に分割してください。
このキットのインサートサイズを教えてください。シーケンスリード長の選択方法を教えてください。
本キットを用いたPCR産物のメインピークは~270 bpです。高品質なカバレッジを得るためにはPE150シーケンスが推奨されます。
IGTR免疫レパートリー解析に推奨されるシーケンスデータ量はどのくらいですか?
200 ngのインプットで0.01%の存在度でクローンを検出するには、最低0.3 Gbのデータ量を推奨します。低頻度クローンの感度を高めるには、データ量を増やしてください。
このキットは最小残存病変(MRD)モニタリングに適していますか?
このキットには IG Primer Mix と TR Primer Mix が含まれており、遺伝子特異的プライマーは別々のチューブに含まれています、
---