β-シヌクレインはシヌクレインタンパク質ファミリーの一員であり、他の2つのメンバーはα-シヌクレインとγ-シヌクレインである。α-シヌクレインはもともと魚類の魚雷の電気器官から主要なシナプス小胞関連タンパク質として単離され、α-シヌクレインの直接のホモログはすべての脊椎動物で見つかっている。その後の研究により、α-シヌクレインの発現はヒトの脳のいくつかの病態と関連しており、パーキンソン病のレビー小体の主要な構成要素となっている。β-シヌクレインは、α-シヌクレインとは明らかに関連しているが異なるタンパク質として、正常および病気のヒト脳の成分として単離された。ヒトのβ-シヌクレイン分子の大きさは134アミノ酸であるのに対し、α-シヌクレインは140アミノ酸であり、両分子のN-末端半分はほぼ同一であるが、C-末端領域はより多様である。
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