次世代シーケンサー(NGS)のサンプル調製には多数のステップが必要であり、各ステップがシーケンサー全体の成功と効率にとって重要であるため、試薬とプロトコルの観点からすべてのステップを最適化する必要があります。NGSサンプルの貴重な性質を考慮すると、最適化された試薬による統合ワークフローが、サンプルをシーケンス可能なライブラリに変換するために必要です。NGSサンプルの種類は様々です:
シーケンスのしやすさ - 一様か、二次構造やGCリッチな領域があるか
品質 - 新鮮な抽出または保存(ホルマリン固定パラフィン包埋 - FFPE)
柔軟なワークフロー - アプリケーションに最適化されたDNAおよびRNAワークフロー
これらすべてのバリエーションを考慮すると、これらすべてのサンプルタイプに効率的に対応できるライブラリー調製試薬を使用することが重要です。高品質のライブラリー調製試薬は、均一でカバレッジの向上した、重複率の低いライブラリーを得るのに役立ちます。最終目的(例えば、全エクソームシーケンス)によっては、特定の関心領域を濃縮するためのターゲット濃縮ステップも必要となります。高効率のターゲット濃縮試薬を使用することで、標的領域に対して高い特異性(オンターゲット率)で均一かつ高いカバレッジ深度を得ることができます。
KAPA HyperPETEワークフローは、KAPAライブラリー調製とKAPAターゲット濃縮の両方に有効な製品を組み合わせたものです。DNAまたはRNAからシーケンサーまで、サンプル調製に必要なすべてのアクセサリーと試薬を1日のワークフローで提供します。新しいKAPA HyperPETE パネルは、高いキャプチャー効率、より少ない最適化で均一なシーケンス、より高いバリアント検出の信頼性を提供します。
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