マイコプラズママイコプラズマとしても知られ、これまで発見された中で最小かつ最も単純な原核生物であり、細胞の15%から35%がマイコプラズマに汚染されていると推定される。マイコプラズマの汚染は、代謝、免疫、生化学的特性、成長状態、細胞の生存など、細胞に多くの影響を与え、実験結果の安定性、信頼性、正確性に影響を与える。マイコプラズマは検出が難しく、除去が困難で、0.22μmの標準フィルターを容易に通過し、ほとんどの抗生物質に拮抗し、細胞培養に大きな損失を与える。そのため、細胞は定期的(例:2~3ヶ月毎)にマイコプラズマの汚染を検査する必要がある。マイコプラズマの検出には、ブロス培養、寒天培養、直接・間接蛍光染色、ELISA、直接・間接PCRなど多くの方法があり、中でも直接PCRが高感度である。
PCR結果の正確性を確保するため、非特異的なPCR増幅や汚染を防ぐために、ホットスタートTaq酵素やUDG(uracil-DNA glycosylase)を使用することが一般的な対策である。
化学修飾されたTaq酵素の活性中心をブロックし、低温や常温では酵素が活性化しないようにし、PCR増幅へのロード前にプライマーのミスマッチによる非特異的増幅が生じないようにしたものである。高温(95℃など)では、化学修飾基が加水分解してすべての酵素活性を放出するため、Taq酵素のホットスタートが実現する。非特異的増幅とプライマー二量体形成を最小限に抑え、増幅の感度と特異性を向上させる。
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