FocuSCOPE™は、同じ単一細胞から遺伝子変異とトランスクリプトームの両方を検出できるハイスループットの単一細胞マルチオミクスシーケンスソリューションです。このように、FocuSCOPE™は、遺伝子型と表現型のつながりを単一細胞レベルで読み解くツールを提供しました。
FocuSCOPE™テクノロジーは、mRNAと目的の配列の両方を効率的に捕捉できるオリゴを結合させたセルバーコーディング微粒子と、mRNA配列とターゲット領域からの配列の両方の増幅とライブラリー構築に最適化した反応化学の2つの主要要素を備えています。 FocuSCOPE™は、一度に数千の細胞から、遺伝子発現プロファイルと点突然変異、融合遺伝子、または細胞内ウイルス配列の両方を同時に解析するシングルセル解析に使用され、成功を収めています。取得したマルチオミクスデータは、個々の細胞についてのより包括的な洞察を提供しました。
ユニークなカスタムデザインビーズ
Singleron社が独自に設計したAccuraCellTMビーズを用いれば、200bp以下の標的領域を最大5つまで同時に捕捉することができます。同一サンプルから、ポリ(dT)プローブによる全トランスクリプトーム用ライブラリーと、カスタムプローブによる標的配列用ライブラリーの2つのライブラリーが構築されることになる。そのため、同一細胞内で、細胞種情報だけでなく、標的配列(変異、融合遺伝子、ウイルス配列)を検出することが可能です。
ドライバー変異の特異的検出
FocuSCOPE®キットは、異種組織からドライバー変異を高い特異性で検出します。以下のデモデータセットでは、3つの細胞株の混合から、H1975細胞株はEGFR T790M点変異を、A549細胞株はKRAS G12S変異を有しています。
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