CLindex™Sample Multiplexing Kitは、同じシングルセルシーケンスライブラリー内に最大16個のサンプルをプールすることができます。
CLindex™マルチプレックステクノロジーは、効率的で偏りのないサンプルタギングを行うためにクリックケミストリーを採用しています。細胞表面タンパク質に親和性の高い化学基と、その化学基に結合するサンプルインデキシングオリゴが、各サンプルの細胞を標識します。抗体による標識と比較して、クリックケミストリーを用いた標識の大きな利点は、クリックケミストリーによって認識される細胞表面タンパク質が豊富で、異なる生物種にまたがって見出されることである。さらに、サンプルタギングにかかる時間はわずか30分です。
効率的なワークフロー
サンプルタグは、1回のGEXSCOPE®ワークフローでサンプルをプールする前に、クリックケミストリーを使用して追加します。サンプルタグの付いたプールされた細胞は、細胞溶解とバーコーディングのためにSCOPE-chip™にロードされます。サンプルタグ(15nt)は、ユニバーサルPCRハンドルとポリ(A)テールで挟まれ、オリゴdTビーズで捕捉されます。サンプルタグは細胞バーコードで標識されています。同時に、同じ単一細胞のmRNAも、そのポリ(A)-テールで磁性オリゴDTビーズに捕捉され、UMIと同様に同じセルバーコードでタグ付けされる。このように、同じ細胞からのcDNA断片はすべて、細胞バーコードという共通項を持つ。細胞バーコードとCLindexタグの両方が、各転写物を元の細胞やサンプルにリンクさせることを保証しています。
高いラベリング効率
4つの独立した細胞株(NB4、THP1、U937、CCRF)をCLindex®で標識し、SCOPE-chip®で細胞分割する前に等量でプールしました。
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