Singleron社のGEXSCOPE®技術を用いると、単一細胞を個々のマイクロウェルに分割し、mRNAをユニークなバーコード付きビーズで捕捉することができます。その後、mRNAはcDNAに逆転写され、さらにサークルハンドルによる環状化工程が行われます。cDNAの円形化により、V(D)J領域はシーケンシングプライマーに近づいた。2回の濃縮の後、生成物は断片化され、イルミナショートリードシーケンス用の全長VDJライブラリーが構築される予定である。
高いRNA捕捉効率とV(D)J特異性
VDJ組換えとは、T細胞やB細胞が、可変(V)、多様(D)、接合(J)遺伝子と呼ばれる異なる遺伝子セグメントをランダムに組み立て、多くの異なるタイプの分子を集合的に認識できる独自の受容体(抗原受容体として知られています)を生成するプロセスです。V(D)J領域は、ヒトゲノム上で最も多様性の高い領域の一つであり、ヒトの複雑な免疫反応に寄与しています。そのため、T細胞やB細胞のV(D)J領域の全長配列を理解することは、免疫プロセスに対するより正確な理解をもたらすことになります。
ハイライト
- 包括的 - トランスクリプトームプロファイリングと完全長TCRまたはBCR配列の組み合わせ
- ハイスループット - 1回の処理で最大10,000個の細胞を同時に処理できます。
- 高いマッピング率 - 完全長V(D)J配列を持つ細胞の比率を高める。
- 高い捕捉効率 - 堅牢なpolyA捕捉を利用する。
アプリケーション
01
免疫微小環境
腫瘍浸潤T細胞・B細胞
02
自己免疫疾患
免疫系の異常なT細胞、B細胞の特定
03
移植
移植の拒絶反応のリスクを特定する
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