コアキットであるSMART-Seq HT Kit (SS-HT) とSMART-Seq HT PLUS Kit (SS-HT PLUS) は、オリゴ(dT) プライミングを使用して、1-100細胞または10 pg-1 ngのトータルRNAから直接、高品質の完全長cDNAを生成する自動化に適したキットです。核となるcDNA合成キットに加え、SS-HT PLUSキットには、イルミナ互換シーケンスライブラリーを作製するためのライブラリー調製キットとシングルユースのユニークデュアルインデックス(UDI)プレートも含まれており、完全なエンドツーエンドソリューションとなっています。
SS-HT cDNA合成キットは、FACSの下流で作業するために最適化された合理化されたプロトコルを持ち、便利な逆転写とPCR増幅を組み合わせたステップの導入により、SMART-Seq v4キットと比較して作業時間を短縮します。cDNA合成の核となるSMART(Switching Mechanism at 5' End of RNA Template)テクノロジーは、全長転写産物のカバレッジを提供し、スプライスジャンクションや代替スプライシングを含む単一細胞における遺伝子発現の研究に強力なツールとなる。オリゴ(dT)プライミングは、高品質のトータルRNA(RIN >8)または無傷の細胞からmRNAを特異的に増幅するために使用される。LNAテクノロジーはテンプレートスイッチングの効率を向上させ、他の方法と比較して同定される遺伝子数を増加させる。
SS-HT PLUSキットには特許取得済みのライブラリー調製ケミストリーが組み込まれており、酵素的断片化とステムループアダプターを使用して、コアキットで合成したcDNAから高品質のイルミナ互換ライブラリーを構築します。この2段階のワークフローは1本のチューブで行われ、約2時間で完了します。
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