塩化物は、細胞外の陰イオンとして最も多く存在する。血漿中の塩化物濃度の低下(低クロロ血症)は、塩類喪失性腎炎、持続的な胃液分泌、長期の嘔吐、有機酸の産生または分泌の増加によって起こる代謝性アシドーシスによって起こることがある。血漿 Cl-濃度の上昇(高クロロ血症)は、脱水、尿細管性アシドーシス、急性腎不全、副腎皮質機能亢進症、サリチル酸中毒、長期の下痢や重炭酸ナトリウムの喪失に伴う代謝性アシドーシスで起こる。
血清中および尿中のアニオンギャップを測定するために、塩化物をナトリウ ムやカリウムと組み合わせて分析することが多い。塩化物と臭化物の反応当量が異なるため、チオシアン酸塩法はイオン選択性電極を用いた測定よりも臭化物の存在による影響を受けにくい。
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