すぐに使えるプレアセンブルバッファーにより、品質を損なうことなく、最短4時間での迅速なライブラリー調製が可能です。
パフォーマンスの向上:ミトコンドリアコンタミネーションを7倍低減したライブラリーを調製することで、リードを節約し、シーケンス深度を向上させます。
卓越した一貫性:新鮮なサンプルと凍結サンプルの両方から、相関性の高い複製を作製します。
概要
Zymo-Seq ATAC Library Kitは、哺乳類の細胞や組織からATAC-Seq (Assay for Transposase Accessible Chromatin with high throughput Sequencing) ライブラリーを調製するためのシンプルで合理的なワークフローを提供します。このキットには、50,000細胞からATAC-Seqライブラリーをわずか4時間で調製できる、簡単なプロトコールが含まれています。
最初の細胞溶解は穏やかに行われ、重要な核は溶解した細胞から紡ぎ出されて回収されるが、汚染されたミトコンドリアDNAは細胞内にとどまって廃棄される。次に、イルミナアダプターをプレロードしたトランスポザーゼが、1回の迅速な反応でオープンクロマチン領域の断片化とタグ付け(tagment)を同時に行う。最後に、タグ付けされたDNAは、UDI Tag Primer Setを用いたPCRでインデックス付けされ増幅され、高品質のライブラリーが生成され、どのイルミナ装置でもシーケンスできるようになります。
DNAインプット - 最適な結果を得るためには、テクニカルレプリケートあたり50,000細胞を使用します。細胞は、生存率(集団内の生きた細胞の割合を示す指標)が80%以上である必要があります。バイアビリティを正確に測定するには、セルカウンターの使用を推奨する。
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