NGSシーケンシングソフト

... QIAGEN CLCアルゴリズムによるすぐに使えるRNA-seq解析パイプライン 一般的なライブラリー調製キットに対応 ユーザーフレンドリーなインタラクティブダッシュボードで、差次的に発現した遺伝子の簡単で直感的な探索とフィルタリングが可能 上流で最も影響を受けるパスウェイとのアノテーションによる解釈サポート QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA) Knowledge Baseからクエリされた上位のパスウェイ、上流のレギュレーター、疾患、機能によるアノテーションによる解釈サポート 製品によるバイオマーカー検証実験の意思決定サポート QIAGEN ...

... BioVisor NGSソフトウェアは、エクソームシーケンスで得られたバリアントを管理することができる。このアプリケーションは、多遺伝子ベースの疾患、遺伝性がん、腫瘍組織の研究、インデックスケースの研究のためのエクソーム比較、流産を繰り返す原因の研究などの仕様を可能にする。 BioVisor NGSは遺伝子データを自動的に解析・解釈し、病態に関連する変異を特定する。さらに、ユーザーの基準に基づいたデータのフィルタリング、ローカルバリアントの管理、ネットワーク化が可能です。 このアプリケーションはローカルで動作するため、遺伝子データ、解析、レポートはユーザーの施設内にのみ存在します。 セキュリティ - ...

... 転写体濃度の精密な推定 発現差の正確な検出 変動する条件下での卓越した再現性 高速なランタイムと小さなメモリフットプリント Mix² RNA-Seqデータ解析ソフトウェア RNA-SeqデータからRNA濃度を正確に推定するためのソフトウェアツールです。 モデル RNA-Seqにおけるフラグメントバイアスは、遺伝子アイソフォームの正確な定量化に対して深刻な課題をもたらします。Mix²は、カバレッジバイアスについて仮定せず、各遺伝子アイソフォームについて混合モデルをデータに適合させます（図1）。したがって、Mix²は、例えば図1（aおよびb）に示すように5'バイアスを正確に表現できますが、一方Cufflinksは均一分布に制限されます（図1c）。 RNA-SeqデータからRNA濃度を正確に推定するためのソフトウェアツールです。 ...

... Partek® Genomics Suite® は、マイクロアレイ、qPCR、および前処理済みの NGS データをデスクトップコンピューターから直接解析することができる統計解析ソフトウェアです。高速かつ俊敏で、メモリ効率に優れています。使いやすいインターフェース、豊富な視覚化機能、一般的なゲノミクスアッセイのためのガイド付きワークフローにより、Partek Genomics Suite は生物学者、バイオインフォマティシャン、統計学者に信頼できる結果をもたらす単一の統合されたソリューションを提供します。 Partek ...

... NextGENeソフトウェアは、Illumina® iSeq, Miniseq, MiSeq, NextSeq, HiSeq, NovaSeqシステム、Ion Torrent Ion GeneStudio S5, PGM, Protonシステム、その他のプラットフォームで生産されたデスクトップ型シーケンスデータの解析に最適な分析パートナーです。 NextGENeはWindows®オペレーティングシステム上で動作し、生物学者にとって使いやすい「ポイント＆クリック」インターフェースを提供します。CLCゲノミクスワークベンチ、LasergeneのSeqMan ...

... GenomSys Variant Analyzerは、MPEG-Gゲノムデータフォーマットにネイティブに対応し、正確なバリアントの同定、アノテーション、解釈（SNV、インデル、CNV）を可能にするCEマーク取得済みのプラットフォームです。GenomSys Variant Analyzerは、最先端のパイプラインとMPEG-G特有の機能を活用し、診断プロセスや治療法の選択において専門家をサポートします。 GenomSys Variant Analyzerの主な利点は以下の通りです。 - ...

... GensearchNGSは、ロッシュ/454、イルミナ、イオントレント、プロトンなどの一般的に使用されるNGS機器からのDNA-Seqデータを分析するための統合ソフトウェアソリューションです。 これは、ヨーロッパの主要な認定診断グループと密接に協力し、NMDchip FP7プロジェクトのサポートを受けて設計および開発されています。 シーケンスの読み込み、バーコード分割、アライメント、バリアント検出、注釈から、検出されたバリアントの最終レポートまで、すべてのステップを統合します。 ...

... SpaceGen臨床NGSデータ解析システムは、次世代シーケンサー（NGS）技術に基づいた臨床データ解析ソフトウェアで、主にヒトゲノム、癌、希少疾患などの遺伝子変異解析、変異検出、バイオインフォマティクス解析に使用されます。 このシステムは、ハイスループットシーケンス技術によって生成されたシーケンスデータの管理をパーソナライズすることを目的とし、データ解析アルゴリズムとバイオインフォマティクス技術を使用して、これらのデータを処理および解析することにより、医師や研究者が病原性遺伝子変異を発見し、疾患を診断し、個別の治療計画を策定することなどに役立ちます。 このシステムの主な特徴は以下の通り： 高精度分析：データ処理と解析に様々なアルゴリズムとストラテジーを使用し、高精度で信頼性の高い遺伝子変異検出と解析を実現。 多様な解析モジュール：ゲノム配列解析、遺伝子型解析、変異検出、構造変異解析、コピー数変異解析、リシークエンス解析などのモジュールを含み、様々な臨床研究シナリオに適用可能。 豊富なデータ可視化：nグラフ、アンプリコン・カバレッジ・グラフなど、データ解析結果を直感的かつ明瞭に表示。 インテリジェントなレポート作成異なる疾患タイプや臨床的特徴に応じて、標準に準拠したレポートをインテリジェントに生成することができ、医師の診断や治療に便利です。 ...