Os isoladores estéreis são utilizados para produzir substâncias tais como infusões mistas (vitaminas, oligoelementos, gorduras) que são utilizadas para alimentar recém-nascidos ou doentes com um trato digestivo comprometido. Os isoladores utilizados para este tipo de aplicação são também designados por isoladores TPN (Total Parenteral Nutrition). Outras aplicações para isoladores estéreis incluem a engenharia de tecidos e o processamento de células vivas. Como aqui são tratados exclusivamente materiais não tóxicos, o isolador funciona em condições de sobrepressão. Consequentemente, os isoladores estéreis são concebidos, em primeiro lugar e acima de tudo, para fornecer proteção ao produto.
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