O kit foi desenvolvido para a construção de bibliotecas de alta qualidade para sequenciação de nova geração (plataformas illumina e MGI). O kit necessita de fragmentos de ADN de cadeia dupla (cegos e/ou pegajosos) como ADN de entrada para a preparação de bibliotecas NGS e é compatível com fragmentos de ADN gerados tanto por métodos enzimáticos como por métodos físicos (sonicação, nebulização, etc.). A multiplexagem da biblioteca é possível com diferentes tipos de índices.
O kit foi optimizado para a preparação de bibliotecas de sequenciação de nova geração (NGS) com diferentes tipos de amostras. A maior parte da preparação de bibliotecas de ADN requer a ligação de fragmentos de ADN cortados a adaptadores de bibliotecas e a preparação de bibliotecas de ADN está intimamente relacionada com a qualidade dos dados NGS. Com as tecnologias exclusivas de preparação de bibliotecas de ADN da BioDynami, o kit rápido e simples permite que a preparação de bibliotecas NGS de alta qualidade seja concluída em 1,5 horas, com apenas 10 minutos de tempo prático
Algumas regiões genómicas são muito difíceis de cobrir uniformemente e resultam normalmente numa taxa de cobertura muito baixa ou em lacunas nessas regiões.
As regiões tipicamente difíceis são:
- com elevado teor de GC
- têm estruturas secundárias: principalmente devido a sequências repetidas
- os piores casos: têm um elevado teor de GC e sequências repetidas.
Exemplo: o gene TERT humano é uma das regiões mais difíceis, como se pode ver acima. Os dados NGS mostraram que o kit BioDynami tem o melhor desempenho para cobrir a região extremamente difícil do gene TERT humano.
Estão disponíveis três tipos de índices para os kits da plataforma illumina:
Non-index : As bibliotecas não têm índice.
Index : Uma sequência de código de barras única com 6 bases foi incluída em cada um dos primers index.
---