O kit de preparação de bibliotecas ChIP-Seq (plataforma illumina e MGI) foi desenvolvido para a construção de bibliotecas ChIP-Seq de alta qualidade utilizando 5 ng a 400 ng de ADN ChIP como entrada. O kit é compatível com fragmentos de ADN ChIP gerados tanto por métodos enzimáticos como por métodos físicos (sonicação, nebulização, etc.).
O ChIP-Seq é a combinação da imunoprecipitação da cromatina (ChIP) com a sequenciação de nova geração. É uma ferramenta poderosa para a análise de factores de transcrição globais e de outras proteínas em doenças e vias biológicas, bem como para a caraterização de modificações de histonas a nível de todo o genoma com uma resolução de base única. O ChIP-Seq permite obter perfis funcionais de factores de transcrição globais ao nível de todo o genoma e permite uma melhor compreensão das modificações epigenéticas.
Estão disponíveis três tipos de índices para o kit de preparação de bibliotecas ChIP-Seq da plataforma illumina:
Non-index : As bibliotecas não têm índice.
Índice: Cada primer de índice contém uma sequência de índice única de 6 bases que pode ser utilizada para identificação. 48 amostras podem ser agrupadas. As informações sobre o índice podem ser descarregadas aqui.
Índice duplo único: É possível a multiplexagem da biblioteca ChIP-Seq para 96 amostras. O nosso sistema exclusivo de índice de diferença de 4 bases tem um comprimento de índice de 8 bases e pelo menos 4 bases são diferentes umas das outras para uma melhor identificação da biblioteca. Os nossos exclusivos primers de indexação dupla eliminam erros de sequenciação, tais como index hopping, contaminação de índices, atribuição incorrecta e outros erros. As informações sobre os índices podem ser descarregadas aqui.
Os índices estão disponíveis para os kits da plataforma MGI .
Vantagens do kit:
Protocolo super rápido
A preparação da biblioteca pode ser efectuada em 1,5 horas
O tempo prático é de apenas cerca de 10 minutos
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