A ribotipagem é uma tecnologia baseada em fragmentos que utiliza enzimas de restrição para atingir e cortar regiões dos genes do ARN ribossómico (5S, 16S, 23S e a região espaçadora que inclui o Glu-tRNA), gerando uma impressão digital de ADN que é única para o organismo ao nível da estirpe.
O sistema Ribotyping agrupa amostras cujos padrões RiboPrint® se enquadram num grau fixo de semelhança. Estes padrões podem ser gerados antes ou depois uns dos outros e podem ser utilizados para determinar o nível de semelhança entre isolados como parte de um exercício de rastreio e tendência num programa de Monitorização Ambiental (EM). A nossa equipa constrói e mantém uma biblioteca personalizada para cada cliente que submete amostras para riboprinting. Sempre que o cliente submete uma nova amostra, esta é comparada com todas as amostras anteriores na sua biblioteca personalizada e atribuída a um RiboGroup.
Em alguns casos, a ribotipagem automatizada pode ser menos eficaz do que a tipagem de estirpes baseada na sequência, uma vez que algumas espécies têm muito pouca diversidade dentro do operão de ARN ribossómico analisado pelo RiboPrinter®. Nestes casos, os métodos baseados na sequência para a caraterização de estirpes bacterianas (SLST e MLST) podem fornecer um nível muito mais elevado de discriminação e repetibilidade do que a ribotipagem automatizada e devem ser fortemente considerados.
O que é a ribotipagem de estirpes bacterianas?
A ribotipagem é uma análise automatizada baseada em fragmentos da impressão digital do ADN do organismo utilizando o sistema RiboPrinter® para a caraterização bacteriana.
O que é um padrão de riboprinting?
A riboprinting é uma tecnologia baseada em fragmentos que utiliza enzimas de restrição para atingir e cortar regiões dos genes do RNA ribossómico (5S, 16S, 23S,
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