O CleanDTR é um sistema eficiente baseado em esferas paramagnéticas, concebido pela CleanNA para remover terminadores de corantes não incorporados em reacções de sequenciação Sanger. Também pode ser utilizado para CRISPR-Cas9. O processo CleanDTR envolve três etapas simples, incluindo ligação, lavagem e eluição. Ao ligar o produto de sequenciação seletivamente às partículas magnéticas, os corantes, nucleótidos, sais e primers não incorporados serão removidos durante as lavagens com etanol. Este princípio permite a eluição do produto de sequenciação Sanger puro no tampão de eluição escolhido. O protocolo pode ser adaptado à sua estação de trabalho de manuseamento de líquidos atual (por exemplo, Beckman, Hamilton, Tecan, Caliper, Perkin Elmer, Agilent e Eppendorf), utilizando o seu protocolo atual, bem como pode ser executado manualmente.
Vantagens
Comprimentos de leitura Phred 20 longos com uma média superior a 800 bps
Taxas de aprovação superiores a 85% ou mais
Eliminação eficiente de contaminantes da reação de sequenciação
Redução da utilização de BigDye*, devido ao aumento da intensidade média do sinal
Aplicações
Limpeza do produto de sequenciação para
Plataformas ABI e MegaBACE
Químicos suportados
- BigDye* versões 1.0, 1.1, 2.0, 3.0 e 3.1
- DYEnamic ET
* BigDye é uma marca registada da Applied Biosystems
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