os nucleósidos 2'-desoxi-2'-fluoro-nucleósidos adoptam uma conformação de açúcar do tipo ARN, presumivelmente devido à elevada eletronegatividade do flúor. Devido a esta conformação de açúcar, os duplexes de ARN (forma A) são geralmente mais estáveis termodinamicamente do que os duplexes de ADN (forma B). Como esperado, a adição de resíduos de 2'-F-RNA aos oligodesoxinucleótidos aumenta progressivamente a estabilidade térmica dos seus duplexes com RNA. A estabilização é aditiva em aproximadamente 2° por resíduo. Isto compara-se favoravelmente com o 2'-OMe-RNA a cerca de 1,5° e o RNA a 1,1° por resíduo. Entretanto, a especificidade do par de bases permanece intacta.
as ligações fosfodiéster do 2'-F-RNA não são resistentes à nuclease, embora as ligações fosforotioato correspondentes sejam altamente resistentes. Os investigadores concebem normalmente oligonucleótidos anti-sentido para formar duplexes com ARN, que são depois substratos para a RNase H. Os duplexes 2'-F-RNA/RNA uniformemente modificados não são substratos para a RNase H. No entanto, é fácil preparar oligonucleótidos fosforotioatos 2'-F-RNA/DNA quiméricos que apresentam uma ligação melhorada ao alvo de ARN, são substratos para a RNase H e são altamente resistentes à nuclease.
Especificações
Química
Massa/peso molecular - 307,17
Armazenamento e estabilidade
Condição de ressuspensão -
- Rodar o tubo brevemente para recolher o sedimento no fundo do tubo - Adicionar um volume adequado do tampão recomendado (consultar a ficha técnica) - Deixar o tubo repousar durante alguns minutos - Agitar o tubo em vórtice durante 15 segundos
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