O painel TargetPlex FFPE-Direct NGS 78-Gene Cancer Hotspot Panel - Primer Pool foi concebido para visar 78 genes oncogénicos ou supressores de tumores com um total de 378 amplicons em pools de três primers (5x). Os primers foram concebidos com a inovadora tecnologia TargetPlex de cancelamento de ruído para aumentar a eficiência da sequenciação e melhorar a sensibilidade de deteção até 1% de frequência alélica. Este produto contém apenas o pool de primers TargetPlex e requer o catálogo TargetPlex Library Prep Kit (compatível com Illumina) ou os kits do catálogo (compatível com Ion Torrent) para completar a biblioteca.
Lista de genes: ( )=número de amplicões
AKT1 (1), AKT2 (1), AKT3 (3), ALK (7), APC (10), AR (2), ARAF (1), ARID1A (9), BAP1 (8), BRAF (3), BRCA1 (2), BRCA2 (2), CDH1 (4), CDK4 (1), CDKN2A (3), CSF1R (2), CTCF (8), CTNNB1 (1), DDR2 (1), ERBB3 (6), ERBB4 (5), ESR1 (4), FAT1 (2), FBXW7 (10), FGFR3 (5), FOXL2 (1), GATA3 (2), GNA11 (2), GNAQ (2), H3F3A (1), HIST1H3B (1), HNF1A (9), IDH1 (1), IDH2 (2), JAK2 (3), KDR (10), KEAP1 (1),KIT (15),KMT2C (2),KMT2D (4),KRAS (3), MAP2K1 (7), MAP2K2 (1), MAP3K1 (3), MLH1 (1), MTOR (4), NF1 (4), NFE2L2 (2), NOTCH1 (8), NRAS (4), PDGFRA (4), PIK3CA (11), PIK3R1 (8), POLE (2), PTEN (23), RAC1 (3), RB1 (5), RET (7), RHOA (3), ROS1 (2), SF3B1 (5), SMAD4 (7), SMARCB1 (4), SMO (4), SRC (1), STK11 (22), TP53 (23), TSC1 (1), TSC2 (2), U2AF1 (2), VHL (3)
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