O FITMASTER possui rotinas de análise e ajuste de dados electrofisiológicos. A análise pode ser efectuada ao nível de Varrimentos/Traços e Séries. Além das funções de ajuste padrão, como polinómios, exponenciais, gaussianos e boltzmanianos, as funções personalizadas para ajustar, por exemplo, traços de corrente de células inteiras de acordo com o formalismo de Hodgkin & Huxley, relações corrente-tensão e curvas dose-resposta permitem uma análise dos seus dados à prova de publicação.
O investigador experiente em patch clamp ficará fascinado com a versatilidade do programa e a estrutura lógica das funções. Todas as características da Análise Online do PATCHMASTER também estão presentes no FITMASTER. Em princípio, o FITMASTER alarga estas capacidades, acrescentando características de análise mais específicas e a geração de uma árvore de análise. O funcionamento de FITMASTER está estreitamente ligado à estrutura em árvore dos dados gerados por PATCHAMSTER até ao nível de uma Série. Assim, o FITMASTER tem níveis hierárquicos de análise equivalentes aos níveis da árvore de dados da Repetição. A análise está organizada de forma estruturada, em relação a Sweeps e Séries. O nível mais baixo é a análise de um traço de dados em bruto, um Traço. A caixa de diálogo TraceFit fornece ferramentas para selecionar uma secção do traço para análise e especificações do tipo de análise a ser realizada. Os valores determinados por esta análise de varrimento podem ser processados posteriormente no SeriesFit. Mas, ao contrário do PULSEFIT, o FITMASTER permite o agrupamento de dados ao nível da Série, introduzindo o novo conceito de buffer de ondas. Vários resultados do TraceFit podem ser compilados no buffer de ondas e depois apresentados no gráfico SeriesFit.
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