O AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 é um ensaio de ressequenciação orientado para a pesquisa de mutações somáticas nas regiões de hotspot de 50 genes com associações conhecidas ao cancro, tal como identificadas na base de dados do Catálogo de Mutações Somáticas no Cancro (COSMIC)1. As principais caraterísticas incluem:
Conteúdo de genes relevantes
Alvo de ~2800 mutações COSMIC de 50 oncogenes e genes supressores de tumores
Fluxo de trabalho rápido e simplificado
Prepare bibliotecas prontas para sequenciação num único dia a partir de apenas 1 ng de amostras de alta qualidade ou 10 ng de amostras fixadas em formalina e incluídas em parafina (FFPE)
Dados exactos
Detetar mutações somáticas até 5% de frequência de alelos variantes usando análise local ou baseada em nuvem
O Cancer HotSpot Panel faz parte de um fluxo de trabalho integrado que inclui AmpliSeq para a preparação de bibliotecas com base na reação em cadeia da polimerase (PCR) da Illumina, tecnologia de sequenciação de nova geração (NGS) da Illumina por síntese (SBS) e análise automatizada.
Este painel permite a deteção de variantes altamente sensíveis em vários tipos de cancro, incluindo pulmão, cólon, mama, ovário, melanoma e próstata. O painel pronto a utilizar poupa-lhe o tempo e o esforço de identificar alvos, conceber primers e otimizar painéis.
Especificações
Tempo do ensaio - 5 horas (apenas preparação da biblioteca; não inclui quantificação da biblioteca, normalização ou tempo de agrupamento)
Tipo de cancro - Pan-cancro, Tumor sólido
Especificações de conteúdo - Regiões Hotspot de 50 genes com associações conhecidas ao cancro
Descrição - Investigação de análise somática em regiões de pontos críticos de 50 genes relacionados com o cancro.
Tempo prático - < 1,5 h
Quantidade de entrada - 1-100 ng (10 ng recomendados por pool)
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