O AmpliSeq for Illumina Focus Panel é um ensaio de ressequenciação direcionado para a análise de biomarcadores de 52 genes com relevância conhecida para os tumores sólidos. Utilizando o Focus Panel, os investigadores podem analisar simultaneamente o ADN e o ARN. As principais caraterísticas incluem:
Conteúdo de genes relevantes
Biomarcadores alvo em 52 genes relevantes para tumores sólidos
Fluxo de trabalho rápido e simplificado
Prepare bibliotecas prontas para sequenciação num único dia a partir de apenas 1 ng de amostras de entrada de alta qualidade ou 10 ng de amostras fixadas em formalina e incluídas em parafina (FFPE)
Dados exactos
Detecte mutações somáticas até 5% de frequência usando análise local ou baseada em nuvem
O Focus Panel faz parte de um fluxo de trabalho integrado que inclui AmpliSeq para preparação de biblioteca baseada em reação em cadeia da polimerase (PCR) Illumina, sequenciação por síntese (SBS) Illumina, tecnologia de sequenciação de nova geração (NGS) e análise automatizada.
Este painel pronto a utilizar poupa-lhe o tempo e o esforço de identificar alvos, conceber primers e otimizar painéis.
Especificações
Tempo do ensaio - 5-6 horas (apenas preparação da biblioteca; não inclui quantificação da biblioteca, normalização ou tempo de pooling)
Tipo de cancro - Tumor sólido
Descrição - Pesquisa de análise somática em 52 genes associados a cancros de tumores sólidos.
Tempo de trabalho - < 1,5 horas
Quantidade de entrada - 1-100 ng (10 ng recomendados por pool)
Número de amplicons - 553 no total. 2 pools. (Pool de ADN: 269 amplicões. Pool de ARN: 284 amplicões)
Tipos de amostras especializadas - tecido FFPE
Classe de variantes - Polimorfismos de nucleótido único (SNPs), Fusões de genes, Variantes somáticas, Inserções-deleções (indels), Variantes do número de cópias (CNVs)
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